jPOSTへのデータ登録

　プロテオミクスにおける質量分析データの共有と統合を目指して、わが国ではjPOSTがデータレポジトリを運営しています。MPSは、技術開発で取得したおもな質量分析データをjPOSTに登録し、順次公開しています。当社のプロテオーム受託分析の出力データ例としてご覧ください。また、受託分析を通じて納品した質量分析データについては、論文投稿用のデータ登録を無償でお受けしています。ぜひご利用ください。

HeLa細胞のプロテオームデータ（標準仕様）

jPOST Project ID JPST000575
分析対象　HeLa細胞（ヒト）
分析の概要　当社標準仕様の質量分析システムを用いてトリプシン加水分解物を測定（試料導入量： 250 ng、500 ng、750 ng および1000 ng）
分析方法　非標識法 (Label-free quantitation, LFQ)
ペプチド分画　なし
質量分析計　Q Exactive
反復測定　LC-MS/MSを各導入量でそれぞれ3回　合計12測定ファイル (.raw)
同定タンパク質グループ数　3649 (FDR 1%)
同定一覧　
ペプチド断片（ファイル名： 190411_250_1000ng_QE_145min_PeptideGroups.txt）
タンパク質（ファイル名： 190411_250_1000ng_QE_145min_Proteins.txt）

2019年4月15日掲載

HeLa細胞の高深度プロテオームデータ

jPOST Project ID JPST000518
分析対象　HeLa細胞（ヒト）
プロテアーゼ　トリプシン
分析方法　非標識法 (Label-free quantitation, LFQ)
ペプチド分画　高pH条件下の逆相分画、8画分
質量分析計　Q Exactive
反復測定　画分ごとにLC-MS/MSを3回　合計24測定ファイル (.raw)
同定タンパク質グループ数　6151 (FDR 1%)
同定一覧　
ペプチド断片（ファイル名： 180815_ProgenesisQI_peptide.csv）
タンパク質（ファイル名： 180815_ProgenesisQI_Protein.csv）